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染料修饰核酸RNA|[email protected] 610/[email protected] 594/Alexa 568/Alexa 555/Alexa 546/Alexa 532修饰核糖核酸RNA

RNA中的每个核苷酸都包含一个核糖，碳原子编号为1'至5'。通常在腺嘌呤（A），胞嘧啶（C），鸟嘌呤（G）或尿嘧啶（U）的1'位上连接碱基。腺嘌呤和鸟嘌呤是嘌呤，胞嘧啶和尿嘧啶是嘧啶。甲磷酸基团连接到下一个位置的3'一个核糖的5'位和。磷酸基团各自带负电荷，使RNA成为带电分子（聚阴离子）。碱基在胞嘧啶和鸟嘌呤之间，腺嘌呤和尿嘧啶之间以及鸟嘌呤和尿嘧啶之间形成氢键。然而，其他相互作用也是可能的，例如一群腺嘌呤碱基彼此相互结合 或具有鸟嘌呤-腺嘌呤碱基对的GNRA 四环。

 

RNA的化学结构

区别于DNA的RNA的重要结构成分是在核糖的2'位置存在羟基。该官能团的存在使得所述螺旋大多采取A型几何，虽然在单链双核苷酸上下文中，RNA可以很少也采用B型DNA中最常观察到的。 A形几何结构导致一个非常深而狭窄的主沟槽和一个又浅又宽的副沟槽。2'-羟基存在的第二个结果是，在RNA分子的构象柔性区域（即不参与双螺旋的形成）中，它可以化学攻击相邻的磷酸二酯键以裂解骨架。

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